嘉靖二十一年，嘉靖帝迷信炼丹以求长生不老，顺天府中惊现少女诱杀事件，多名未及笄的少女被诱杀后开颈取血，脖颈上留下一圈齐整的伤痕。江湖传言，这伤口来自一种极其特殊的武器，血滴子。一时间人心惶惶，民心不稳。锦衣卫镇抚使苏灿命令新晋锦衣卫杨程万查案，却被卷入宫变之中，杨却被人设计成为嫌犯，蒙冤进入诏狱。查一案诡谲秘辛，唱一出人情冷暖。

清雍正皇帝处心铲除异己，御前侍卫辛康把西域武器血滴子献皇，这种武器能在百步之外，取人首级，神不知，鬼不觉，雍正秘密组织血滴子特务团；在连续几次暗杀行动后，成员马腾发现遭杀者均为无辜义士，不甘沦为杀人工具，趁夜潜出京，惟雍并未放松追捕……

反映江湖义士刺杀暴君雍正的一段可歌可泣的悲壮故事。清雍正年间，大兴文字狱，许多文人无辜被杀。雍正为铲除异己，训练暗杀集团“血滴子”，大肆屠杀民间义士，以前“血滴子”成员马腾和大侠白泰官、吕四娘为首的反清组织，不惜牺牲生命，混入宫中，与众多高手做殊死搏斗。

一位年轻的女剑客有隐身能力，并喜欢对人恶作剧，后来她惹怒了恐怖分子和强盗，不得不去对付他们。战斗中女剑客中毒，一位英俊的医生救了她，康复后她把其余的坏人都赶走了，而医生则在寻找治疗隐身的方法。

清雍正年间，朝廷对汉人极尽歧视，实行残酷统治，江南文人查嗣亭、吕留良、汪谨琪秉于正义、着文立论、攻击暴政。雍正震怒，乃大兴文字狱，将查等满门抄斩，汉民群起激愤，势如江河。

“血滴子以革为囊，内藏快刀数把，控以机关，用时趁人不备，囊罩其头，拨动机关，首级立取，是为冷兵器时期战斗工具之极致，创於清雍正时期，专为清除异己之秘密武器……”时值清初盛世，乾隆继承皇位。京城中有一个叫人闻风而丧胆的组织“血滴子”—身怀绝世本领的王磊，率领陈泰、胡图、穆森、十三、布喀等多名年轻高手，专门执行朝廷秘密任务，缉杀反清异己。在王磊指挥若定下，众人默契配合天衣无缝，每次以秘密兵器「血滴子」取敌首级有如探囊取物，执行过三百四十八趟任务依然从未失手。辉煌战绩令他们越来越自负，也令他们逐渐失去戒心。